在可見的未來，人類偶然發現了被喻為之謎的“蓋塔射線”，但是無人知道，那將會是世界末日的開始……由于INVADER突然來襲，月球在轉眼之間被占領，跟著，它們的魔爪企圖伸展到地球。人類用高科技的結晶——“超級機器人”，經過長達十年的“月世界戰爭”，成功把可怕的侵略者消滅了，但是……　　早乙女博士以未開發成功的『三一萬能俠』迎擊反被擊潰!一方面博士著手開發『新·三一萬能俠』；另一方面，認為必須找到3位合適的駕駛員....